本报上海8月7日电 记者颜维琦、通讯员华亭 从上海海洋大学获悉，克日，该校陈良标、胡鹏传授研究团队，在活体鱼类胚胎中实现了单细胞新生RNA测序技能的体系优化和应用，初次实现对“合子激活”阶段新转录基因的高敏捷度、高正确性检测。这项技能不但打开了研究生命劈头奥秘的新窗口，也为水产育种的基因精准计划提供了紧张工具。相干研究结果在线发表于《天然·通讯》。
当精子与卵子联合，细胞的“运气之书”翻开了第一页。然而在受精卵中绝大多数基因最初是“甜睡”的，真正决定生命历程的是那些在关键时候被寂静“叫醒”的基因——它们犹如指挥家，引导着整个发育的睁开。
每个新生命的开始都要履历一次“交代”——从母亲提供的遗传物质过渡到胚胎自主控制基因表达，这一过程被称为母源-合子转换，是胚胎发育中最关键的迁移转变点。然而，刚被激活的合子基因，其转录本数目极其稀疏，又经常被海量的母源RNA“湮没”。这使得传统的测序技能很难“闻声”这些薄弱却至关紧张的“声音”。
胡鹏曾在博士后期间到场开辟了检测新合成RNA的前沿技能单细胞新生RNA测序技能，此次研究中，团队围绕鱼类胚胎模子开展了体系性优化。一方面实现体系评估标志方法，对10种主流RNA化学转化方法举行了体系筛选，并在凌驾5万个斑马鱼细胞中测试。终极发现基于mCPBA/TFEA的“on-beads”转化方案能实现凌驾8%的T-to-C更换率，体现远优于传统“体内标志”方法，在信号强度和RNA质量上均体现杰出。另一方面精准标志新合成RNA，团队在模式鱼类斑马鱼受精卵的一细胞阶段显微注射4-硫尿苷，实现了对合子新转录RNA的高效标志，便于后续辨认。
据先容，该研究实现了诸多突破。起首，优化后的方法能在海量母源RNA配景下清楚捕获新合子RNA信号。其次，通过盘算新RNA占比，可以或许准确判断哪些基因是胚胎合子激活的。末了，该研究辨认出更多此前未被报道的合子激活基因，并通过原位杂交实行验证其在整胚中的表达模式。 |
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